药学院始建于1960年，其前身为南京中医学院中药系，是全国创建最早的中药高等教育院（系）之一，学院秉承“尚德务实、精诚卓越”的院训，以立德树人为根本，历经几代中药学/药学人的辛勤耕耘，已经成为实力雄厚、教学科研水平名列前茅的高等中药教育基地。

 学院由七系（中药资源与鉴定系、中药炮制系、中药制剂系、药理学系、中药化学与分析系、药物化学系、生物制药与食品科学系）、两中心（实验教学中心、分析测试中心）和两合建学院（新中药学院、康缘中药学院）组成。与中科院上海药物所合作共建“新中药学院”、与中国中医科学院合作开办中药学“屠呦呦班”，探索培养卓越科学家（中药学“4+5”本博连读创新拔尖人才）；与附属康缘药业合作共建“康缘中药学院”，探索培养卓越工程师（中药学“4+3”创新应用人才）。下设三个委员会：学术委员会、学位委员会、教学委员会。

中药学学科为“双一流”建设学科、国家重点学科、江苏省优势学科，全国第五轮学科评估中获得A+，支撑我校化学、临床医学、生物学与生物化学、神经科学与行为学、分子生物学与遗传学、农业科学等5个学科进入ESI全球排名前1%，药理学与毒理学学科进入ESI前1‰。中药资源化学、中药炮制学2个学科为国家中医药管理局高水平重点学科。药学为江苏省优势学科、重点学科。

本科专业有中药学、中药资源与开发、中药制药、药学、临床药学、药物制剂、制药工程、生物制药、食品质量与安全，其中与澳大利亚Griffith University合作举办生物制药（3+1）双学位项目，与澳大利亚RMIT University合作举办食品质量与安全（3+1）双学位项目。中药学、药学、中药资源与开发3个专业入选国家级一流本科专业建设点，中药学、中药资源与开发为国家特色专业，中药制药、药物制剂、制药工程、生物制药和食品质量与安全专业入选省级一流本科专业建设点。生物制药与食品质量与安全专业为江苏省合作办学高水平示范项目，中药学为江苏省国际化品牌专业、中药制药为江苏省产教融合品牌专业、制药工程专业为省卓越工程师教育培养计划2.0专业。硕士学位点有药学、中药学一级学科科学学位硕士点和专业学位硕士点；博士学位点有中药学一级学科博士学位授权点，形成了本科、硕士、博士完整的教学层次和人才培养体系。中药学学科设有博士后流动站。

学院在职职工280余人，其中专任教师230余人。专任教师中具有博士学位教师占90%以上，有正高74名，副高109名。学院有全国第二批“黄大年式教师团队”——中药资源学教师团队，中国工程院院士1人，欧亚国际院士1人，国家973计划首席科学家1人、长江学者1人、国家杰青1人、岐黄学者1人，青年岐黄学者2人，国家有突出贡献中青年专家2人、全国师德建设先进个人1人、国家药典委员会委员3人、以及全国中医药高等学校教学名师、全国中医药杰出贡献奖、全国优秀教师、全国优秀科技工作者、江苏省特聘教授、江苏省“五一”劳动奖章获得者、江苏省教学名师、江苏省“333”高层次人才等众多优秀专家人才。中药学、药学学科有博士研究生导师73名，硕士研究生导师102名。

学院有中药学类国家级实验教学示范中心（南京中医药大学）、中药学类国家级虚拟仿真实验教学中心（南京中医药大学），3个省级实验教学示范中心，1个省基础学科拔尖学生培养计划2.0基地，1个省级产教融合重点基地建设点，36个省级研究生工作站，与附属江苏康缘药业共建国家级现代产业学院。与附属江苏康缘药业共建中药制药过程控制与智能制造技术全国重点实验室、国家发改委中药资源产业化与方剂创新药物国家地方联合工程研究中心、教育部中药炮制规范化及标准化工程研究中心、江苏省中药资源产业化过程协同创新中心等省部级以上科研平台22个。

近年来，学院牵头承担国家自然科学基金重大项目、重点项目、杰出青年项目、国际联合基金项目，国家重点研发计划，国家重大新药创制专项等科研项目多项；先后获国家科学技术进步奖二等奖3项、省部级科学技术奖一等奖6项、新药证书1项，新药临床批件3项，保健食品证书1项。在Chem Rev、Molecular plant、Mol Cell、JACS、Angew等杂志发表高水平论文90余篇。有国家级精品在线开放课程2门、国家虚拟仿真实验项目1项、国家级一流课程5门、主编规划教材80部，江苏省重点教材10部，出版代表性主编教材98本。近五年以来，获得中国学位与研究生教育学会教学成果奖二等奖1项、省级教学成果二等奖3项、江苏省研究生教育改革成果奖一等奖、二等奖各1项。省级以上教学竞赛获奖27人次。承担省级及以上教学改革项目10项。省级产业教授18名，研究生导师类产业教授36名。教育部产教协同育人项目7项。

学院现有各类学生5000余人，其中研究生1894人。学院坚持以学生为中心的教育理念，以本为本，完善“三全育人”体制机制，“以质量为核心，以创新为灵魂”，全面推进教育质量文化建设。获得全国中医药优秀博士学位论文提名论文2篇，全国药学专业学位研究生优秀学位论文2篇，江苏省优秀博士、硕士学位论文35篇，江苏省优秀本科毕业论文67篇。近三年来，学院学生在“挑战杯”全国大学生课外学术科技作品竞赛中获得一等奖2项、二等奖3项、三等奖1项，累进创新专项奖1项；获得“挑战杯”中国大学生创业计划竞赛银奖2项、铜奖2项；获得中国国际“互联网＋”大学生创新创业大赛银奖1项；获得全国大学生生命科学竞赛二等奖2项；获得全国大学生创新体验竞赛一等奖1项、三等奖4项。

学院以开放的视野，积极开展国内外交流与合作，努力提高人才培养质量。学院与美国Harvard Medical School、澳大利亚Griffith University、澳大利亚RMIT University、英国Queen's University（Belfast）、加拿大University of Toronto、香港浸会大学、香港科技大学、澳门大学、澳门科技大学、中国科学院上海药物研究所、中国中医科学院、军事科学院军事医学研究院毒物药物研究所、江苏省中国科学院植物研究所、中国协和医科大学、北京大学、清华大学、浙江大学、南京大学、中国药科大学等国内外著名高校与科研院所建立了长期稳定的教学科研协作关系。与全国医药企业、研究院所、药检院（所）、医院等130余家单位建立了稳定的教学实习基地。教学、科研和科技成果转化总体实力位居全国同类院系前列。

学院将牢固确立人才培养的中心地位，树立科学的高等教育发展观，坚持稳定规模、优化结构、强化特色、注重创新，走以质量提升为核心的内涵式发展道路。将进一步彰显中药学专业优势和特色，紧贴行业需求，聚焦中药学“双一流”学科建设，提高治理能力和治理水平，注重教学和科研并举，积极发展学院和企业联盟，砥砺前行，把学院建设成为师资力量雄厚、教学科研成果均居国内同类院系前列的一流药学院，为我国医药产业的发展贡献力量。

（数据截止时间为2024年9月）