1. 国家自然科学基金面上项目（82274055），水生中药三棱性状“以质地坚实为佳”的生物学基础及形成机制研究，2023/01-2026/12，主持，51万元
2. 国家自然科学基金面上项目（81973435），基于单细胞分析技术研究环境因子对荆芥药材品质形成的机制，2020/01-2023/12，主持，54万元
3. 国家自然科学基金面上项目（81773854），芡实药材品质形成的相关基因克隆及分子机理研究，2018/01-2021/12，主持，57万元
4. 国家自然科学基金面上项目（81473313），基于荆芥腺毛生物学特性的药材品质形成机理研究， 2015/01-2018/12，主持，68万元
5. 国家自然科学基金面上项目(81073002)，水体环境改变对三棱药材品质形成的影响及分子机制，2011/01-2014/12，主持，33万元
6. 国家中医药行业科研专项（201507002），30种中药饮片产地加工与炮制生产一体化关键技术规范研究，2015/06-2017/06，主持，1092万元
7. 国家公益性行业专项（201407002），我国水生、耐盐中药资源的合理利用研究，2014/01-2016/12，第2 主持，1019万元
8. 国家公共卫生行业专项（2014002），国家基本药物所需（江苏省）中药材种子种苗繁育基地建设，2014/01-2016/12，第2 主持，1000万元
9. 国家十二五支撑计划课题(2011BAI04B06)，芡实等8种大宗中药材质量标准提高及其综合利用研究，2011/01-2014/12，主持，524万元
10. 国家中药标准化项目（ZYBZH-C-TS-31），热毒灵注射液标准化建设，2016/01-2018/12，分项目主持，100万元
