专利
1. 吴启南, 周婧, 乐巍, 邵莹, 陈广云, 王新胜. 淡竹叶总黄酮在制备防治心肌缺血疾病的药物及功能性食品中的应用, 2014.6, 中国, ZL 201210226041.3
2. 吴启南, 沈蓓, 周婧, 等. 一种营养全面、具有健脾作用的芡实双皮奶及其芡实藕粉与腐竹, 2013.12, 中国, ZL 201210226042.8
3. 吴启南, 刘明, 周婧, 等. 一种淡竹叶精制总黄酮的制备方法, 2011.7, 中国, ZL 201010148037.0
4. 梁侨丽, 吴启南, 樊大平, 等. 抗动脉粥样硬化的黑三棱内酯B化合物及其制备方法, 2012.5, 中国, ZL 200910033686.3
5. 梁侨丽, 吴启南, 张海波, 等. 一种具有镇痛活性的三棱总酚的制备方法, 2013.4, 中国, ZL 201110132215.5
6. 梁侨丽, 樊大平, 吴启南, 等. 黑三棱内酯B作为TLR2和TLR4拮抗剂在制药中的应用, 2013.3, 中国, ZL 201110110987.9
7. 谷巍, 巢建国, 吴启南, 等. 鉴别道地药材茅苍术的特异DNA分子标记及其制备方法和其应用, 2012.11, 中国,ZL 201010106459.1
论著
1. 主编：《新编中国药材学》，中国医药科技出版社，2020年7月
2. 主编：国家执业药师考试指南《中药学专业知识（一）》，中国医药科技出版社. 2019年2月
3. 第2 主编：《江苏省中药资源区划》，上海科技出版社，2021年6月
4. 副主编：《中药资源化学》--理论基础与资源循环利用，科学出版社，2015年10月
5. 副主编：《中药废弃物的资源化利用》, 化学工业出版社，2013年12月
教材
1. 主编：《中药鉴定学》，人民卫生出版社，2021年7月
2. 主编：《中药鉴定学》（第二版），中国医药科技出版社. 2018年8月
3. 主编：《中药鉴定学实验》（第二版）， 中国医药科技出版社. 2018年8月
4. 主编：《中药材商品学》， 中国中医药出版社. 2013年8月
5. 副主编：《中药鉴定学》， 中国中医药出版社. 2021年8月、2016年8月、2012年8月
