1. 潘扬（2/5），山茱萸抗糖尿病血管病变的物质基础及作用机理分析，南京市政府，南京市科学技术进步奖，二等奖，2006（许惠琴，潘扬，卢金福，皮文霞，朱荃）
2. 潘扬（2/5），中药质量控制关键技术——中药指纹图谱研究，南京市政府，南京市科学技术进步奖，二等奖，2005（蔡宝昌，潘扬，丁岗，李伟东，狄留庆）
3. 潘扬（2/7），中药质量控制关键技术——中药指纹图谱研究，江苏省政府，江苏省科学技术进步奖，二等奖，2005（蔡宝昌，潘扬，丁岗，李伟东，狄留庆，贾晓斌，刘训红）
4. 潘扬（5/7），凉血通瘀法治疗出血性中风病急性期的研究，江苏省政府，江苏省科学技术进步奖，二等奖，2001（周仲瑛，金妙文，吴勉华，方泰惠，潘扬，周学平，王志英）
5. 潘扬（1/5），山茱萸抗厥脱有效成分的筛选及其作用机理的研究，江苏省卫生厅，江苏省中医药科技进步奖，一等奖，2000（潘扬，王天山，方泰惠，程鸿齐，许惠琴）
