1. 国家自然科学基金重大项目（81991520），海洋药源分子的发现及形成机制，2020/01-2024/12，1800万，主持。

2. 国家重点研发计划中医药现代化研究重点专项（2018YFC1706200），常用中药活性成分的合成生物学研究，2018.12-2021.12，1760万，主持。

3. 国家自然科学基金重点项目（81530089），真菌酚胺耦合产生的新先导化合物发现，2016.01/-2020/12，274万，主持。

4. 国家自然科学基金委创新研究群体科学基金（81421091、81121062、30821006），天然药源分子及其新作用特点，2009-2017连续3轮滚动资助，1750万，主持。

5. 国家自然科学基金重点项目（21132004），特境及不可培养微生物产生的新活性物质研究，2012/01-2016/12，300万，主持。

6. 国家科技重大专项“重大新药创制”（2009ZX09501-013），微生物活性产物分离及分析关键技术，2009/01-2011/12，743万，主持。

7. 国家863计划目标导向项目（2007AA09Z446），海洋共生菌活性物质的高效利用，2007/08-2010/12，363万，主持。

8. 国家自然科学杰出青年基金项目（39725033），药用蒿及其内生菌生物活性物质的研究，1998/01-2000/12，60万，主持。

1. 国家自然科学基金重大项目（81991520），海洋药源分子的发现及形成机制，2020/01-2024/12，1800万，主持。

2. 国家重点研发计划中医药现代化研究重点专项（2018YFC1706200），常用中药活性成分的合成生物学研究，2018.12-2021.12，1760万，主持。

3. 国家自然科学基金重点项目（81530089），真菌酚胺耦合产生的新先导化合物发现，2016.01/-2020/12，274万，主持。

4. 国家自然科学基金委创新研究群体科学基金（81421091、81121062、30821006），天然药源分子及其新作用特点，2009-2017连续3轮滚动资助，1750万，主持。

5. 国家自然科学基金重点项目（21132004），特境及不可培养微生物产生的新活性物质研究，2012/01-2016/12，300万，主持。

6. 国家科技重大专项“重大新药创制”（2009ZX09501-013），微生物活性产物分离及分析关键技术，2009/01-2011/12，743万，主持。

7. 国家863计划目标导向项目（2007AA09Z446），海洋共生菌活性物质的高效利用，2007/08-2010/12，363万，主持。

8. 国家自然科学杰出青年基金项目（39725033），药用蒿及其内生菌生物活性物质的研究，1998/01-2000/12，60万，主持。

1. Y. S. Wang+, W. Zheng+, N. Jiang+, Y. X. Jin+, Z. K. Meng, M. X. Sun, Y. L. Zong, T. Xu, J. P. Zhu*, R. X. Ren*. Alteration of the catalytic reaction trajectory of a vicinal oxygen chelate enzyme by directed evolution. Angew. Chem. Int. Ed.2022, doi:10.1002/anie.202201321.

2. X. M. Wu+, Q. Y. Guan+, Y. B. Han, X. C. Wang, W. Y. Zhuang, and R. X. Tan*. Regeneration of phytochemicals by structure-driven organization of microbial biosynthetic steps. Angew. Chem. Int. Ed.2022, 61, e202114919.

3. Y. B. Han+, W. Bai+, C. X. Ding, J. Liang, S.-H. Wu, and R. X. Tan*. Intertwined biosynthesis of skyrin and rugulosin A underlies the formation of cage-structured bisanthraquinones. J. Am. Chem. Soc. 2021, 143, 14218–14226.

4. F. W. Jiao+, Y. S. Wang+, X. T. You, W. Wei, Y. Chen, C. L. Yang, Z. K. Guo, B. Zhang, Y. Liang*, R. X. Tan*, R. H. Jiao* and H. M. Ge*. An NADPH-dependent ketoreductase catalyses the tetracyclic to pentacyclic skeletal rearrangement in chartreusin biosynthesis. Angew. Chem. Int. Ed.2021, 60, 1–8.

5. L. P. Lin+, D. Liu+, J. C. Qian, L. Wu, Q. Zhao, R. X. Tan*. Post-ingestion conversion of dietary indoles into anticancer agents. Nat. Sci. Rev. 2022, 9, nwab144.

6. G. Z. Dai, W. B. Han, Y. N. Mei, K. Xu, R. H. Jiao, H. M. Ge, R. X. Tan*. Pyridoxal-5’-phosphate-dependent bifunctional enzyme catalyzed biosynthesis of indolizidine alkaloids in fungi. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A.2020, 117, 1174–1180.

7. B. Zhang, K. B. Wang, W. Wang, X. Wang, F. Liu, J. P. Zhu, J. Shi, L. Y. Li, H. Han, K. Xu, H. Y. Qiao, X. Zhang, R. H. Jiao, K. N. Houk*, Y. Liang*, R. X. Tan*, H. M. Ge*. Enzyme-catalysed [6+4] cycloadditions in the biosynthesis of natural products. Nature2019, 568, 122–126.

8. X. M. Wu, R. X. Tan*. Interaction between gut microbiota and ethnomedicine constituents. Nat. Prod. Rep. 2019, 36, 788–809.

9. L. P. Lin, N. Jiang, H. M. Wu, Y. N. Mei, J. Yang, R. X. Tan*. Cytotoxic and antibacterial polyketide-indole hybrids synthesized from indole-3-carbinol by Daldinia eschscholzii. Acta Pharm. Sin. B 2019, 9, 369-380.

10. Z. Z. Zhou, H. J. Zhu, L. P. Lin, X. Zhang, H. M. Ge, R. H. Jiao, R. X. Tan*. Dalmanol biosyntheses require coupling of two separate polyketide gene clusters. Chem. Sci.2019, 10, 73–82.

2010年：谭仁祥. 谈家桢生命科学奖创新奖

2009年：谭仁祥(排名1) . 若干重要药用植物的成分研究. 国家自然科学奖二等奖

2007年：谭仁祥(排名1). 植物内生真菌代谢物研究. 教育部提名国家科学技术奖(自然科学奖)一等奖

2007年：谭仁祥. 植物内生菌产物的化学和生物学评价. <天然产物报道>报告奖(英国皇家化学会)

2005年：谭仁祥(排名1). 民间常用草药成分的分析与功能研究. 教育部提名国家科学技术奖(自然科学奖)一等奖

1. 于广利（主编）、谭仁祥（主编），《海洋天然产物与药物研究开发》，科学出版社，2016，北京（60.4万字）

2. 谭仁祥主编，王剑文副主编. 《甾体化学》，化学工业出版社，北京，2008(43.6万字)

3. 谭仁祥主编， 石建功、郭跃伟、徐琛副主编. 《功能海洋生物分子——发现与应用》，科学出版社，北京，2007(110.9万字)

4. 谭仁祥主编，王剑文、徐琛、崔贵友副主编. 《植物成分功能》，科学出版社，北京，2003(110.3万字)

5. 谭仁祥主编，孟军才、陈道峰、焦庆才副主编.《植物成分分析》，科学出版社，北京，2002(100.6万字，2004年再版)