| 序号 | 设站单位名称 | 合作高校名称 | 设站时间 | 评优时间 |
| 1 | 江苏苏中药业集团股份有限公司 | 南京中医药大学 | 2010 | |
| 2 | 江苏康缘药业股份有限公司 | 南京中医药大学 | 2010 | 2017 |
| 3 | 南京海昌中药集团有限公司 | 南京中医药大学 | 2012 | 2018、2021 |
| 4 | 江苏神龙药业有限公司 | 南京中医药大学 | 2012 | 2018 |
| 5 | 江苏省食品药品检验所 | 南京中医药大学 | 2012 | |
| 6 | 江苏大昌生物科技有限公司 | 南京中医药大学 | 2014 | 取消 |
| 7 | 江阴天江药业有限公司 | 南京中医药大学 | 2014 | 2019、2020 |
| 8 | 张家港市中医医院 | 南京中医药大学 | 2015 | 2019 |
| 9 | 南京海源中药饮片有限公司 | 南京中医药大学 | 2016 | 2020 |
| 10 | 盐城市中医院 | 南京中医药大学 | 2017 | 2021 |
| 11 | 江苏正大丰海制药有限公司 | 南京中医药大学 | 2017 | |
| 12 | 精华制药集团股份有限公司 | 南京中医药大学 | 2017 | |
| 13 | 扬子江药业集团有限公司 | 南京中医药大学 | 2017 | |
| 14 | 江苏鼎泰药物研究股份有限公司 | 南京中医药大学 | 2018 | |
| 15 | 泰州医药城国科化物生物医药科技有限公司 | 南京中医药大学 | 2018 | |
| 16 | 南京艾德凯腾生物医药有限责任公司 | 南京中医药大学 | 2018 | |
| 17 | 南京市食品药品监督检验院 | 南京中医药大学 | 2018 | |
| 18 | 江苏亚邦爱普森药业有限公司 | 南京中医药大学 | 2018 | |
| 19 | 雷允上药业集团有限公司 | 南京中医药大学 | 2018 | |
| 20 | 镇江市第三人民医院 | 南京中医药大学 | 2018 | |
| 21 | 南京市中医院 | 南京中医药大学 | 2018 | |
| 22 | 江苏省长泰药业有限公司 | 南京中医药大学 | 2019 | |
| 23 | 南京中山制药有限公司 | 南京中医药大学 | 2019 | |
| 24 | 常州市中医医院 | 南京中医药大学 | 2019 | |
| 25 | 南京圣和药业股份有限公司 | 南京中医药大学 | 2020 | |
| 26 | 江苏柯菲平医药股份有限公司 | 南京中医药大学 | 2020 | |
| 27 | 江苏艾迪药业股份有限公司 | 南京中医药大学 | 2020 | |
| 28 | 南京中医药大学附属南京医院（南京市第二医院）） | 南京中医药大学 | 2020 | |
| 29 | 江苏开元药业有限公司 | 南京中医药大学 | 2020 | |
| 30 | 江苏弘典中药产业研究院有限公司 | 南京中医药大学 | 2020 | |
| 31 | 苏州市药品检验检测研究中心 | 南京中医药大学 | 2021 | |
| 32 | 北京易才宏业管理顾问有限公司 | 南京中医药大学 | 2021 |
